Hướng dẫn

Hoàn Thuế VAT Trong Xuất Nhập Khẩu 2025 chi tiết A->Z

13 Th4, 2025 Hướng dẫn

Tổng quan bài viết

Là đơn vị tiên phong trong lĩnh vực vận chuyển hàng hóa quốc tế, Cường Phát Logistics hiểu rõ tầm quan trọng của việc tối ưu hóa chi phí trong hoạt động xuất nhập khẩu. Một trong những cơ hội tiết kiệm đáng kể mà nhiều doanh nghiệp bỏ qua chính là quy trình hoàn thuế giá trị gia tăng (VAT). Bài viết này sẽ cung cấp cho quý vị những thông tin chi tiết và hướng dẫn cụ thể về cách thức hoàn thuế VAT hiệu quả khi sử dụng dịch vụ vận chuyển quốc tế.


Thuế VAT là gì và tại sao cần hoàn thuế VAT?

Thuế giá trị gia tăng (VAT – Value Added Tax) là một loại thuế gián thu áp dụng trên giá trị tăng thêm của hàng hóa và dịch vụ trong quá trình sản xuất, lưu thông đến tiêu dùng. Tại Việt Nam, mức thuế VAT phổ biến là 10%, tuy nhiên một số mặt hàng và dịch vụ có thể được áp dụng mức thuế 5% hoặc 0%.

Đối với các doanh nghiệp tham gia vào hoạt động xuất nhập khẩu, việc hoàn thuế VAT mang lại nhiều lợi ích:

  • Giảm chi phí vận hành và tăng tính cạnh tranh
  • Cải thiện dòng tiền cho doanh nghiệp
  • Tuân thủ đúng quy định pháp luật về thuế
  • Tối ưu hóa hiệu quả kinh doanh
Hoàn thuế VAT thuế GTGT

Các trường hợp được hoàn thuế VAT trong vận chuyển quốc tế

1. Đối với hàng hóa xuất khẩu

Khi doanh nghiệp xuất khẩu hàng hóa ra nước ngoài, các chi phí vận chuyển quốc tế liên quan đến quá trình này thường được áp dụng mức thuế VAT 0%. Tuy nhiên, doanh nghiệp vẫn phải nộp thuế VAT cho các dịch vụ liên quan ở thị trường nội địa. Những khoản thuế này có thể được hoàn lại thông qua quy trình hoàn thuế VAT.

2. Dịch vụ vận chuyển quốc tế

Các dịch vụ vận chuyển hàng hóa quốc tế, bao gồm vận chuyển đường biển, đường hàng không và đường bộ xuyên quốc gia, thường được áp dụng mức thuế VAT 0%. Tuy nhiên, điều này không đồng nghĩa với việc miễn thuế hoàn toàn, mà đơn giản là thuế suất được áp dụng là 0%.

3. Dịch vụ kho bãi và logistics

Các dịch vụ kho bãi, đóng gói, bảo quản và logistics khác phục vụ cho hàng hóa xuất khẩu cũng có thể được xem xét hoàn thuế VAT nếu đáp ứng đầy đủ các điều kiện theo quy định.

4. Hàng tái xuất

Đối với hàng hóa nhập khẩu vào Việt Nam sau đó tái xuất ra nước ngoài, doanh nghiệp có thể được hoàn thuế VAT đã nộp trong quá trình nhập khẩu ban đầu.


Điều kiện để được hoàn thuế GTGT (VAT)

Để được hoàn thuế VAT trong hoạt động vận chuyển quốc tế, doanh nghiệp cần đáp ứng các điều kiện sau:

1. Đối tượng được hoàn thuế

  • Doanh nghiệp có đăng ký kinh doanh hợp pháp
  • Đã đăng ký và kê khai thuế VAT theo phương pháp khấu trừ
  • Có hóa đơn VAT hợp lệ cho các khoản chi phí liên quan
  • Có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt với hóa đơn có giá trị từ 20 triệu đồng trở lên

2. Hồ sơ chứng từ cần thiết

  • Tờ khai hải quan hàng hóa xuất khẩu đã hoàn thành thủ tục hải quan
  • Hợp đồng vận chuyển quốc tế
  • Hóa đơn VAT gốc đối với các dịch vụ đã sử dụng
  • Chứng từ thanh toán qua ngân hàng
  • Hợp đồng mua bán hàng hóa với đối tác nước ngoài
  • Chứng từ chứng minh hàng hóa đã được vận chuyển ra khỏi Việt Nam

3. Thời hạn nộp hồ sơ hoàn thuế

Theo quy định hiện hành, doanh nghiệp có thể nộp hồ sơ hoàn thuế VAT trong thời hạn 10 năm kể từ thời điểm phát sinh quyền hoàn thuế. Tuy nhiên, để đảm bảo quyền lợi và dòng tiền, doanh nghiệp nên tiến hành thủ tục hoàn thuế càng sớm càng tốt.


Quy trình hoàn thuế VAT chi tiết

Bước 1: Chuẩn bị hồ sơ

Doanh nghiệp cần chuẩn bị đầy đủ các tài liệu cần thiết như đã liệt kê ở trên. Đặc biệt chú ý đến tính hợp lệ của các hóa đơn VAT và chứng từ thanh toán, vì đây là căn cứ chính để cơ quan thuế xem xét việc hoàn thuế.

Bước 2: Kê khai thuế VAT

Doanh nghiệp cần kê khai đầy đủ các khoản thuế VAT đầu vào trong mẫu tờ khai thuế VAT hàng tháng hoặc quý (mẫu 01/GTGT). Đối với các khoản đề nghị hoàn thuế, cần ghi rõ trong phần dành cho “Thuế GTGT đầu vào được khấu trừ”.

Bước 3: Lập hồ sơ đề nghị hoàn thuế

Sau khi kê khai thuế, doanh nghiệp cần lập hồ sơ đề nghị hoàn thuế bao gồm:

  • Giấy đề nghị hoàn thuế (mẫu 01/ĐNHT)
  • Bảng kê hóa đơn, chứng từ hàng hóa, dịch vụ mua vào (mẫu 01-1/ĐNHT)
  • Bảng kê hóa đơn, chứng từ hàng hóa, dịch vụ bán ra (mẫu 01-2/ĐNHT)
  • Các tài liệu chứng minh khác theo yêu cầu

Bước 4: Nộp hồ sơ hoàn thuế

Hồ sơ hoàn thuế có thể được nộp theo một trong các phương thức sau:

  • Nộp trực tiếp tại cơ quan thuế quản lý
  • Gửi qua đường bưu điện
  • Nộp trực tuyến qua Cổng thông tin điện tử của Tổng cục Thuế

Bước 5: Theo dõi quá trình xử lý

Theo quy định, cơ quan thuế có thời hạn giải quyết hoàn thuế như sau:

  • Không quá 6 ngày làm việc kể từ ngày nhận đủ hồ sơ đối với các trường hợp hoàn thuế trước kiểm tra
  • Không quá 40 ngày làm việc đối với các trường hợp hoàn thuế sau kiểm tra

Bước 6: Nhận tiền hoàn thuế

Sau khi được phê duyệt, tiền hoàn thuế sẽ được chuyển vào tài khoản ngân hàng của doanh nghiệp đã đăng ký với cơ quan thuế.

Quy trình hoàn thuế VAT GTGT

Những thách thức trong quá trình hoàn thuế VAT

1. Phức tạp về thủ tục hành chính

Quy trình hoàn thuế VAT thường đòi hỏi nhiều giấy tờ, chứng từ và có thể gây khó khăn cho doanh nghiệp, đặc biệt là các doanh nghiệp vừa và nhỏ không có bộ phận kế toán chuyên nghiệp.

2. Thời gian xử lý kéo dài

Mặc dù có quy định về thời hạn xử lý, nhưng trên thực tế, quá trình hoàn thuế có thể kéo dài do cần thẩm định, kiểm tra và xác minh thông tin.

3. Thay đổi chính sách

Chính sách thuế VAT có thể thay đổi theo thời gian, đòi hỏi doanh nghiệp phải liên tục cập nhật để đảm bảo tuân thủ.

4. Rủi ro bị từ chối hoàn thuế

Không hiếm trường hợp hồ sơ hoàn thuế bị từ chối do thiếu sót trong chứng từ hoặc không đáp ứng đủ điều kiện theo quy định.


Lời khuyên từ Cường Phát Logistics cho việc hoàn thuế VAT hiệu quả

1. Duy trì hệ thống quản lý chứng từ chặt chẽ

Thiết lập một hệ thống lưu trữ và quản lý chứng từ rõ ràng, có tổ chức. Điều này không chỉ giúp quá trình hoàn thuế diễn ra suôn sẻ mà còn hỗ trợ trong trường hợp có kiểm tra, thanh tra về sau.

2. Cập nhật kiến thức về chính sách thuế

Thường xuyên cập nhật những thay đổi trong chính sách thuế VAT thông qua các nguồn tin chính thống như website của Tổng cục Thuế hoặc tham gia các hội thảo, khóa đào tạo chuyên đề.

3. Sử dụng dịch vụ tư vấn chuyên nghiệp

Đối với những doanh nghiệp không có nguồn lực nội bộ mạnh về kế toán thuế, việc sử dụng dịch vụ tư vấn thuế chuyên nghiệp là một lựa chọn đáng cân nhắc. Cường Phát Logistics có thể kết nối quý khách với các đối tác tư vấn thuế uy tín.

4. Lập kế hoạch hoàn thuế chiến lược

Thay vì chờ đợi đến khi số tiền thuế VAT đầu vào khá lớn mới làm thủ tục hoàn thuế, doanh nghiệp nên có kế hoạch hoàn thuế theo định kỳ để tối ưu dòng tiền.

5. Tận dụng công nghệ số

Sử dụng các phần mềm kế toán và quản lý thuế hiện đại để tự động hóa việc theo dõi, tính toán và chuẩn bị hồ sơ hoàn thuế VAT.


Dịch vụ hỗ trợ hoàn thuế VAT từ Cường Phát Logistics

Hiểu được những khó khăn mà doanh nghiệp gặp phải trong quá trình hoàn thuế VAT, Cường Phát Logistics cung cấp các dịch vụ hỗ trợ chuyên nghiệp bao gồm:

1. Tư vấn hoàn thuế VAT

Đội ngũ chuyên gia của chúng tôi sẽ phân tích tình hình cụ thể của doanh nghiệp và đề xuất phương án hoàn thuế VAT phù hợp nhất.

2. Hỗ trợ chuẩn bị hồ sơ

Cường Phát Logistics hỗ trợ doanh nghiệp chuẩn bị đầy đủ các giấy tờ, chứng từ cần thiết để đảm bảo hồ sơ hoàn thuế được chấp thuận nhanh chóng.

3. Giám sát tiến độ hoàn thuế

Chúng tôi có thể theo dõi và cập nhật tiến độ xử lý hồ sơ hoàn thuế, đồng thời chủ động liên hệ với cơ quan thuế để giải quyết các vướng mắc phát sinh.

4. Tối ưu hóa chiến lược thuế

Không chỉ hỗ trợ hoàn thuế VAT đơn lẻ, Cường Phát Logistics còn tư vấn chiến lược thuế dài hạn, giúp doanh nghiệp tiết kiệm chi phí và tuân thủ pháp luật.

Xem thêm


Cập nhật mới nhất về chính sách hoàn thuế VAT năm 2025

Số hóa quy trình hoàn thuế

Từ đầu năm 2025, Tổng cục Thuế đã đẩy mạnh số hóa quy trình hoàn thuế VAT, cho phép doanh nghiệp nộp và theo dõi hồ sơ hoàn thuế hoàn toàn trực tuyến. Điều này giúp rút ngắn thời gian xử lý và tăng tính minh bạch trong quá trình hoàn thuế.

Mở rộng đối tượng hoàn thuế trước kiểm tra

Các doanh nghiệp có lịch sử tuân thủ tốt và đáp ứng một số tiêu chí nhất định có thể được hoàn thuế trước kiểm tra, giúp cải thiện dòng tiền nhanh chóng.

Áp dụng trí tuệ nhân tạo trong phân loại rủi ro

Cơ quan thuế đang triển khai các hệ thống AI để phân loại và đánh giá rủi ro đối với hồ sơ hoàn thuế, giúp tập trung nguồn lực kiểm tra vào các trường hợp có rủi ro cao và đẩy nhanh quá trình xử lý đối với các hồ sơ có rủi ro thấp.


Những câu hỏi thường gặp về hoàn thuế VAT

1. Doanh nghiệp nhỏ có được hoàn thuế VAT không?

Có, doanh nghiệp ở mọi quy mô đều có thể được hoàn thuế VAT nếu đáp ứng đủ điều kiện theo quy định. Tuy nhiên, doanh nghiệp phải đăng ký nộp thuế VAT theo phương pháp khấu trừ để đủ điều kiện hoàn thuế.

2. Thời gian hoàn thuế VAT thông thường là bao lâu?

Theo quy định, thời gian hoàn thuế VAT là 6 ngày làm việc đối với hoàn thuế trước kiểm tra và 40 ngày làm việc đối với hoàn thuế sau kiểm tra. Tuy nhiên, trên thực tế, thời gian có thể kéo dài hơn tùy thuộc vào tính phức tạp của hồ sơ và khối lượng công việc của cơ quan thuế.

3. Có thể hoàn thuế VAT cho các dịch vụ vận chuyển nội địa không?

Đối với dịch vụ vận chuyển nội địa phục vụ trực tiếp cho hàng hóa xuất khẩu, doanh nghiệp có thể được xem xét hoàn thuế VAT nếu có đầy đủ chứng từ chứng minh mối liên hệ trực tiếp giữa dịch vụ vận chuyển và hàng hóa xuất khẩu.

4. Làm thế nào để xử lý khi hồ sơ hoàn thuế bị từ chối?

Khi hồ sơ hoàn thuế bị từ chối, doanh nghiệp nên:

  • Tìm hiểu rõ lý do từ chối
  • Bổ sung, hoàn thiện các chứng từ còn thiếu hoặc chưa đạt yêu cầu
  • Nộp lại hồ sơ hoàn thuế sau khi đã hoàn thiện
  • Trong trường hợp không đồng ý với quyết định của cơ quan thuế, doanh nghiệp có quyền khiếu nại theo quy định

5. Có phải tất cả hàng xuất khẩu đều được áp dụng thuế suất VAT 0% không?

Không phải tất cả hàng xuất khẩu đều được áp dụng thuế suất VAT 0%. Một số trường hợp đặc biệt như xuất khẩu tài nguyên, khoáng sản chưa qua chế biến hoặc đã qua chế biến nhưng giá trị tăng thêm không quá 51% có thể không được áp dụng thuế suất VAT 0%.


Kết luận

Hoàn thuế VAT là một quyền lợi hợp pháp của doanh nghiệp trong hoạt động vận chuyển hàng hóa quốc tế. Với quy trình đúng đắn và sự hỗ trợ chuyên nghiệp, việc hoàn thuế có thể giúp doanh nghiệp tiết kiệm đáng kể chi phí và tối ưu hóa dòng tiền.

Cường Phát Logistics, với kinh nghiệm lâu năm trong lĩnh vực vận chuyển quốc tế và mạng lưới đối tác rộng khắp, cam kết đồng hành cùng doanh nghiệp trong việc tối ưu hóa chi phí vận chuyển, bao gồm cả việc hoàn thuế VAT hiệu quả.

Hãy liên hệ với Cường Phát Logistics ngay hôm nay để được tư vấn chi tiết về dịch vụ vận chuyển quốc tế và các giải pháp hoàn thuế VAT phù hợp với doanh nghiệp của quý vị.

Thông tin liên hệ:

Cường Phát Logistics – Đối tác tin cậy cho mọi hành trình vận chuyển quốc tế của doanh nghiệp Việt!